Las leyes antisemitas de Vichy en Arjelia a partir de 1940 golpearon duramente a los djudios de Arjelia.
En el marko de su politika antisemita, el rejimen de Vichy derogo el Dekreto Crémieux por medio de la ley del 7 de oktobre de 1940. Esta medida brutal privo a unos 110 000 djudios de Arjelia de su nasionalidad i de su sivdadania fransesa, kolokandolos en una situasion de grande vulnerabilidad. Los djudios fueron sometidos al Estatuto de los Djudios, eksluidos de las profesiones liberales, de las funksiones publikas, i sometidos al numerus clausus en la ensenyansa. Miembros del linaje Encaoua figuran entre los eksluidos de las eskolas i las profesiones. El Dekreto Crémieux no fue restablesido ofisialmente asta el 21 de oktobre de 1943, por el Komite Fransez de la Liberasion Nasional, despues del dezembarko aliado en el norte de Afrika de noviembre de 1942.
Entre oktobre de 1940 i oktobre de 1943, los djudios de Arjelia bivieron un periodo de despozesion i de umiliasion sistematika. Los ninyos fueron eksluidos de las eskolas publikas (limites del numerus clausus al 14% i despues al 7%), las profesiones liberales serradas, las empresas 'arianizadas'. Para los Encaoua, kuya sivdadania fransesa estava solidamente ankorada dezde avia 70 anyos, esta regresion fue bivida komo un trauma profundo. La komunidad djudia de Oran, ande bivian numerozos Encaoua, fue partikularmente afektada por las medidas diskriminatorias i el klima de antisemitizmo atizado por la propaganda vichysta.
La independensia de Arjelia en djulio de 1962 provoko el eksodo masivo de unos 130 000 djudios, la mayoria verso la Fransia metropolitana, algunos verso Israel. Para los Encaoua, esto sinyifikava el fin de una prezensia de kaji sinko siglos en Arjelia —dezde la instalasion de Éphraïm Al-Naqua en Tlemcen en 1391—. La partida se izo en la urjensia i el dezgarro: las famiyas deshavan kazas avitadas durante jenerasiones, sinagogas konstruidas por sus antepasados, simiteryos ande repozavan sus muertos. La komunidad djudia de Tlemcen, ke ainda kontava kon varios sentenares de miembros, se disperso en pokas semanas, prinsipalmente verso París, Marsella i Montpellier.
La yegada a la Fransia metropolitana marko para los Encaoua el empesijo de una nueva era. Los repatriados tuvieron ke rekonstruir sus vidas en un paiz ke konsideravan komo el suyo (grasias al Dekreto Crémieux), ma ke a menudo los akojia kon indiferensia u ostilidad. Frente a esta prova, los Encaoua dieron amostra de la mizma resiliensia ke sus antepasados despues de 1391 i 1492: rekonstituyeron redes komunitarias, fundaron asosiasiones kulturales, mantuvieron biva la memoria de los lugares abandonados. Asosiasiones komo MORIAL (Memoria i tradisiones de los Djudios de Arjelia), de la ke Didier Nebot es prezidente de onor, dezempenyan un papel esensial en la prezervasion de este legado.